熒光定量PCR是分子生物學實驗手段,也是檢驗科常用的方法。它通過熒光染料或熒光標記的具有特異性的探針,對PCR產(chǎn)物進行標記跟蹤,可以實時在線監(jiān)控反應(yīng)過程,結(jié)合相應(yīng)的軟件可以對產(chǎn)物進行分析,計算待測樣品模板的初始濃度,也被稱為實時熒光定量pcr。
它是在PCR定性技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展起來的核酸定量技術(shù)。該技術(shù)不僅實現(xiàn)了對DNA模板的定量,而且具有靈敏度高、特異性和可靠性更強、能實現(xiàn)多重反應(yīng)、自動化程度高、無污染性、具實時性和準確性等特點,目前已廣泛應(yīng)用于分子生物學研究和醫(yī)學研究等領(lǐng)域。在該技術(shù)中,有一個很重要的概念是Ct值。C代表Cycle, t代表threshold, Ct值的含義是:每個反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號到達設(shè)定的域值時所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)。研究表明,每個模板的Ct值與該模板的起始拷貝數(shù)的對數(shù)存在線性關(guān)系,起始拷貝數(shù)越多,Ct值越小。利用已知起始拷貝數(shù)的標準品可做出標準曲線,其中橫坐標代表起始拷貝數(shù)的對數(shù),縱坐標代表Ct值。因此,只要獲得未知樣品的Ct值,即可從標準曲線上計算出該樣品的起始拷貝數(shù)。
熒光定量pcr常用的兩種方法分別為:熒光染料摻入法和探針法
1、熒光染料摻入法
熒光染料摻入法原理是:在PCR反應(yīng)體系中,加入過量熒光染料,熒光染料特異性地摻入DNA雙鏈后,發(fā)射熒光信號,而不摻入鏈中的染料分子不會發(fā)射任何熒光信號,從而保證熒光信號的增加與PCR產(chǎn)物的增加*同步。
2、探針法
探針法熒光定量pcr原理是:PCR擴增時在加入一對引物的同時加入一個特異性的熒光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標記一個報告熒光基團和一個淬滅熒光基團。探針完整時,報告基團發(fā)射的熒光信號被淬滅基團吸收;PCR擴增時,Taq酶的5’-3’外切酶活性將探針酶切降解,使報告熒光基團和淬滅熒光基團分離,從而熒光監(jiān)測系統(tǒng)可接收到熒光信號,即每擴增一條DNA鏈,就有一個熒光分子形成,實現(xiàn)了熒光信號的累積與PCR產(chǎn)物形成同步。